Protein–RNA interactions for Protein: P05023

ATP1A1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1P05023 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A1P05023 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP1A1P05023 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms