Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV12-3P01733 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms