Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNB1P01574 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms