Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LTAP01374 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LTAP01374 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTAP01374 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTAP01374 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTAP01374 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTAP01374 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTAP01374 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTAP01374 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTAP01374 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTAP01374 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTAP01374 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTAP01374 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTAP01374 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTAP01374 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTAP01374 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTAP01374 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTAP01374 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTAP01374 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTAP01374 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTAP01374 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTAP01374 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTAP01374 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTAP01374 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTAP01374 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTAP01374 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTAP01374 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTAP01374 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LTAP01374 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTAP01374 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTAP01374 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTAP01374 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LTAP01374 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTAP01374 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTAP01374 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LTAP01374 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LTAP01374 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LTAP01374 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LTAP01374 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTAP01374 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LTAP01374 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTAP01374 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTAP01374 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LTAP01374 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LTAP01374 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LTAP01374 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTAP01374 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTAP01374 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTAP01374 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTAP01374 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTAP01374 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTAP01374 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTAP01374 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTAP01374 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTAP01374 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTAP01374 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTAP01374 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTAP01374 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTAP01374 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTAP01374 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LTAP01374 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTAP01374 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTAP01374 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTAP01374 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTAP01374 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTAP01374 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTAP01374 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTAP01374 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTAP01374 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTAP01374 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTAP01374 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTAP01374 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTAP01374 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTAP01374 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTAP01374 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTAP01374 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTAP01374 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTAP01374 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTAP01374 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTAP01374 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTAP01374 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTAP01374 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTAP01374 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTAP01374 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTAP01374 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTAP01374 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTAP01374 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTAP01374 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTAP01374 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTAP01374 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTAP01374 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTAP01374 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTAP01374 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTAP01374 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTAP01374 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTAP01374 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTAP01374 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTAP01374 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTAP01374 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTAP01374 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms