Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1RP00736 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1RP00736 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1RP00736 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1RP00736 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1RP00736 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1RP00736 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C1RP00736 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1RP00736 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1RP00736 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1RP00736 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1RP00736 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1RP00736 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1RP00736 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C1RP00736 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1RP00736 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1RP00736 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1RP00736 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1RP00736 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1RP00736 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1RP00736 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1RP00736 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1RP00736 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1RP00736 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1RP00736 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1RP00736 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1RP00736 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1RP00736 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1RP00736 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1RP00736 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1RP00736 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1RP00736 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1RP00736 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1RP00736 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1RP00736 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1RP00736 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1RP00736 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1RP00736 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1RP00736 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C1RP00736 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C1RP00736 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1RP00736 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1RP00736 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1RP00736 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1RP00736 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1RP00736 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1RP00736 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1RP00736 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1RP00736 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1RP00736 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1RP00736 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1RP00736 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1RP00736 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1RP00736 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1RP00736 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1RP00736 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1RP00736 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1RP00736 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1RP00736 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1RP00736 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1RP00736 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1RP00736 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1RP00736 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1RP00736 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1RP00736 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1RP00736 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1RP00736 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1RP00736 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1RP00736 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1RP00736 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1RP00736 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1RP00736 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1RP00736 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1RP00736 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C1RP00736 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1RP00736 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1RP00736 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1RP00736 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1RP00736 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C1RP00736 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1RP00736 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C1RP00736 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1RP00736 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1RP00736 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1RP00736 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1RP00736 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1RP00736 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1RP00736 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1RP00736 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1RP00736 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1RP00736 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1RP00736 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C1RP00736 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1RP00736 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1RP00736 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C1RP00736 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1RP00736 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1RP00736 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1RP00736 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1RP00736 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms