Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRUB2O95900 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms