Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms