Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM13AO94988 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM13AO94988 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms