Protein–RNA interactions for Protein: O94964

SOGA1, Protein SOGA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA1O94964 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SOGA1O94964 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms