Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL18O94889 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL18O94889 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL18O94889 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL18O94889 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL18O94889 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL18O94889 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL18O94889 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL18O94889 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL18O94889 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL18O94889 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL18O94889 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL18O94889 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL18O94889 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL18O94889 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL18O94889 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL18O94889 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL18O94889 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL18O94889 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL18O94889 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL18O94889 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL18O94889 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL18O94889 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL18O94889 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL18O94889 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL18O94889 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms