Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLIT2O94813 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SLIT2O94813 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLIT2O94813 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLIT2O94813 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms