Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSDE1O75534 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms