Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BNIP3LO60238 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms