Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSNA1O43805 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms