Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms