Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD6O43541 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms