Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC36■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
SYNJ1O43426 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SYNJ1O43426 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms