Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLXNB1O43157 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms