Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFIT3O14879 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFIT3O14879 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFIT3O14879 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFIT3O14879 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFIT3O14879 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFIT3O14879 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFIT3O14879 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFIT3O14879 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFIT3O14879 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFIT3O14879 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFIT3O14879 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFIT3O14879 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFIT3O14879 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IFIT3O14879 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFIT3O14879 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFIT3O14879 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFIT3O14879 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFIT3O14879 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFIT3O14879 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFIT3O14879 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFIT3O14879 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFIT3O14879 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IFIT3O14879 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFIT3O14879 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFIT3O14879 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFIT3O14879 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFIT3O14879 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFIT3O14879 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
IFIT3O14879 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms