Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN9O14815 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms