Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CITO14578 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CITO14578 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CITO14578 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CITO14578 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CITO14578 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CITO14578 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CITO14578 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CITO14578 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CITO14578 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CITO14578 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CITO14578 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CITO14578 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CITO14578 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CITO14578 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CITO14578 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CITO14578 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CITO14578 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CITO14578 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CITO14578 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CITO14578 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CITO14578 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CITO14578 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CITO14578 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CITO14578 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CITO14578 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CITO14578 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CITO14578 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CITO14578 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CITO14578 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CITO14578 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CITO14578 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CITO14578 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CITO14578 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CITO14578 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CITO14578 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CITO14578 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CITO14578 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CITO14578 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CITO14578 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CITO14578 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CITO14578 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CITO14578 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CITO14578 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CITO14578 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CITO14578 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CITO14578 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CITO14578 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CITO14578 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CITO14578 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CITO14578 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CITO14578 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CITO14578 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CITO14578 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CITO14578 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CITO14578 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CITO14578 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CITO14578 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CITO14578 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CITO14578 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CITO14578 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CITO14578 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CITO14578 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CITO14578 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CITO14578 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CITO14578 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CITO14578 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CITO14578 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CITO14578 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CITO14578 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CITO14578 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CITO14578 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CITO14578 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CITO14578 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CITO14578 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CITO14578 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CITO14578 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CITO14578 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CITO14578 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CITO14578 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CITO14578 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CITO14578 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CITO14578 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CITO14578 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CITO14578 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CITO14578 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CITO14578 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CITO14578 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CITO14578 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CITO14578 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CITO14578 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CITO14578 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CITO14578 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CITO14578 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CITO14578 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CITO14578 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CITO14578 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CITO14578 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CITO14578 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CITO14578 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms