Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRAFD1O14545 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAFD1O14545 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAFD1O14545 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAFD1O14545 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAFD1O14545 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAFD1O14545 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAFD1O14545 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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