Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms