Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
H7C1W4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
H7C1W4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
H7C1W4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
H7C1W4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
H7C1W4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
H7C1W4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
H7C1W4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
H7C1W4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
H7C1W4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
H7C1W4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
H7C1W4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
H7C1W4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
H7C1W4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
H7C1W4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
H7C1W4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
H7C1W4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
H7C1W4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
H7C1W4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
H7C1W4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
H7C1W4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
H7C1W4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
H7C1W4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
H7C1W4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
H7C1W4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
H7C1W4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
H7C1W4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
H7C1W4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
H7C1W4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
H7C1W4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
H7C1W4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
H7C1W4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
H7C1W4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
H7C1W4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
H7C1W4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
H7C1W4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
H7C1W4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
H7C1W4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
H7C1W4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
H7C1W4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
H7C1W4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
H7C1W4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
H7C1W4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
H7C1W4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
H7C1W4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
H7C1W4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
H7C1W4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
H7C1W4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
H7C1W4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
H7C1W4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
H7C1W4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
H7C1W4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
H7C1W4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
H7C1W4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
H7C1W4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
H7C1W4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
H7C1W4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
H7C1W4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
H7C1W4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
H7C1W4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
H7C1W4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
H7C1W4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
H7C1W4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
H7C1W4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
H7C1W4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
H7C1W4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
H7C1W4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
H7C1W4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
H7C1W4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
H7C1W4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
H7C1W4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
H7C1W4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
H7C1W4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
H7C1W4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
H7C1W4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
H7C1W4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
H7C1W4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H7C1W4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
H7C1W4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H7C1W4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H7C1W4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
H7C1W4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H7C1W4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H7C1W4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
H7C1W4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H7C1W4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
H7C1W4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H7C1W4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H7C1W4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H7C1W4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H7C1W4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
H7C1W4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
H7C1W4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
H7C1W4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
H7C1W4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
H7C1W4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
H7C1W4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
H7C1W4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
H7C1W4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
H7C1W4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms