Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E9PMD0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E9PMD0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
E9PMD0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E9PMD0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PMD0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PMD0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PMD0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PMD0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PMD0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PMD0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PMD0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PMD0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PMD0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PMD0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PMD0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PMD0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PMD0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PMD0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PMD0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PMD0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PMD0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PMD0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PMD0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PMD0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PMD0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PMD0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
E9PMD0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E9PMD0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E9PMD0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E9PMD0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
E9PMD0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E9PMD0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E9PMD0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E9PMD0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E9PMD0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E9PMD0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E9PMD0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E9PMD0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E9PMD0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E9PMD0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E9PMD0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E9PMD0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E9PMD0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E9PMD0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E9PMD0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E9PMD0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E9PMD0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E9PMD0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E9PMD0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E9PMD0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E9PMD0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E9PMD0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E9PMD0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E9PMD0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E9PMD0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E9PMD0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E9PMD0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PMD0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E9PMD0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
E9PMD0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E9PMD0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
E9PMD0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
E9PMD0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
E9PMD0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
E9PMD0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
E9PMD0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
E9PMD0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E9PMD0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms