Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L21D6R901 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L21D6R901 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L21D6R901 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L21D6R901 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L21D6R901 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L21D6R901 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L21D6R901 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L21D6R901 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP17L21D6R901 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms