Protein–RNA interactions for Protein: A8MV23

SERPINE3, Serpin E3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINE3A8MV23 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINE3A8MV23 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms