Protein–RNA interactions for Protein: A7E2V4

ZSWIM8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM8A7E2V4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZSWIM8A7E2V4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSWIM8A7E2V4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms