Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD3A6NKT7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD3A6NKT7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD3A6NKT7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD3A6NKT7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD3A6NKT7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD3A6NKT7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD3A6NKT7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD3A6NKT7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD3A6NKT7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD3A6NKT7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD3A6NKT7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD3A6NKT7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms