Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF233A6NK53 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF233A6NK53 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms