Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms