Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6CA6NDK9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms