Protein–RNA interactions for Protein: A6NDI0

TRIM49B, Putative tripartite motif-containing protein 49B, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49BA6NDI0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49BA6NDI0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49BA6NDI0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49BA6NDI0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49BA6NDI0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49BA6NDI0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49BA6NDI0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49BA6NDI0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49BA6NDI0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49BA6NDI0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49BA6NDI0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49BA6NDI0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49BA6NDI0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49BA6NDI0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49BA6NDI0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49BA6NDI0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49BA6NDI0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49BA6NDI0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49BA6NDI0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49BA6NDI0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49BA6NDI0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49BA6NDI0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49BA6NDI0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49BA6NDI0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM49BA6NDI0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49BA6NDI0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms