Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms