Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSDA5PKW4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms