Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 NAP1L3-201ENST00000373079 2639 ntAPPRIS P2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 STAT6-205ENST00000543873 3119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AMBN-201ENST00000322937 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 COG2-202ENST00000366669 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 LRRC46-201ENST00000269025 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 JUP-201ENST00000310706 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 EPB41L1-212ENST00000441639 5967 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 FAM131A-201ENST00000310585 3677 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 DUSP27-203ENST00000443333 4034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 OCIAD1-205ENST00000444354 1756 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 LINC01977-201ENST00000576963 1788 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AKAP1-208ENST00000572557 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 SLC28A1-204ENST00000538177 2155 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 RFX6-201ENST00000332958 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 ANAPC4-210ENST00000510092 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 LINC00469-201ENST00000321800 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 SLAMF9-202ENST00000368093 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 METTL5-203ENST00000392640 800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AL136531.1-201ENST00000412497 480 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AL121672.2-201ENST00000412643 867 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 CST13P-203ENST00000413633 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AC006001.3-205ENST00000428370 579 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 GAMTP2-201ENST00000430917 463 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 CDK5P1-201ENST00000442838 877 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AL138895.1-201ENST00000448674 173 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 RN7SL668P-201ENST00000493933 303 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 SLC10A7-205ENST00000507030 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AC092471.1-201ENST00000536497 572 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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PTPRJQ12913 AC109446.3-201ENST00000567344 641 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AC026464.4-201ENST00000570054 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 RPAIN-214ENST00000574003 561 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 ASMTL-AS1-205ENST00000602357 435 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AC007128.2-202ENST00000606016 543 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AL359747.1-202ENST00000606028 918 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AC008103.1-201ENST00000623570 1181 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 CDK10-222ENST00000625631 140 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 S1PR3-201ENST00000358157 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AC008764.9-201ENST00000624284 2505 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
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PTPRJQ12913 PDXDC1-202ENST00000396410 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 NR1H4-201ENST00000188403 1630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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PTPRJQ12913 RPS14-202ENST00000401695 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 SLC39A14-203ENST00000359741 4641 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 ARHGAP12-203ENST00000375245 4958 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 SALL2-207ENST00000614342 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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PTPRJQ12913 SLC45A4-202ENST00000517878 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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PTPRJQ12913 NFATC1-202ENST00000318065 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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PTPRJQ12913 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 TCF12-202ENST00000333725 4719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 SART3-202ENST00000431469 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 PRIMA1-202ENST00000393140 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 KPRP-201ENST00000606109 2492 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 ARL4C-201ENST00000339728 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 MOB4-202ENST00000323303 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 ATP9B-203ENST00000458297 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 CCDC57-205ENST00000392346 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 DNM1L-230ENST00000553257 2699 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 DGCR8-202ENST00000383024 4419 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AGK-201ENST00000355413 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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