Protein–RNA interactions for Protein: S4R3F8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S4R3F8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
S4R3F8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
S4R3F8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
S4R3F8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
S4R3F8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
S4R3F8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
S4R3F8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
S4R3F8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
S4R3F8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
S4R3F8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
S4R3F8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
S4R3F8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
S4R3F8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
S4R3F8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
S4R3F8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
S4R3F8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
S4R3F8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
S4R3F8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
S4R3F8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
S4R3F8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
S4R3F8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
S4R3F8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
S4R3F8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
S4R3F8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
S4R3F8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
S4R3F8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
S4R3F8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
S4R3F8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
S4R3F8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
S4R3F8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
S4R3F8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
S4R3F8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
S4R3F8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
S4R3F8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
S4R3F8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
S4R3F8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
S4R3F8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
S4R3F8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
S4R3F8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
S4R3F8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms