Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX10Q9Y5X0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms