Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF3C3Q9Y5Q9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms