Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL4A3BPQ9Y5P4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms