Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPRBQ9Y5M8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms