Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF1Q9Y548 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms