Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRRAPQ9Y4A5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms