Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF330Q9Y3S2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms