Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED16Q9Y2X0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms