Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GINS2Q9Y248 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GINS2Q9Y248 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms