Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SHOC2Q9UQ13 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHOC2Q9UQ13 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SHOC2Q9UQ13 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHOC2Q9UQ13 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHOC2Q9UQ13 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHOC2Q9UQ13 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHOC2Q9UQ13 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHOC2Q9UQ13 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHOC2Q9UQ13 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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