Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms