Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNX7Q9UNH6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX7Q9UNH6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms