Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

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Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRQQ9UMZ3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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